У 1987 році барабанщик Кріс Рейферт разом з Чаком Шульдінер трудився над дебютним альбомом "Death" "Scream Bloody Gore". Однак Чак у властивій йому манері після запису платівки розігнав свою команду і Кріс тимчасово залишився не при справах. Проте його молодому організму потрібний вихід енергії, і Рейферт вирішив створити свій власний проект.
Обізвавши своє дітище "Autopsy", він залучив до справи гітаристів Денні Корралеса та Еріка Катлера, а обов'язки вокаліста Кріс взяв на себе. У 1987-му було записано перший демо з чотирьох треків - "Human Genocide", "Embalmed", "Stillborn", "Mauled To Death". У музичному плані демка нагадувала творчість "Death". На наступний рік пішла ще одна, "Critical Madness", витримана в такому ж дусі.
Однак, після виходу першого альбому, "Severed Survival", стало ясно, що "Autopsy" більше схиляються до хардкору та грінкору, ніж до чистого дету.
У записі платівки взяв участь басист "Sadus" Стів Діджорджіо. У наступні європейському турі він вже не зміг взяти участь, і замість нього на гастролі відправився Кен совари. Компанію групі в цій поїздці складали "Bolt thrower" і "Pestilence". Після повернення до Америки Кен був замінений братом Еріка Катлера, Стівом. Однак незабаром його місце зайняв Джош Барон (екс-"Suffocation", але цей товариш пробув у колективі недовго і пішов у "Welt". Якийсь час басуху знову терзав Стів, а для запису EP "Fiend For Blood" і чергового альбому знову запросили всюдисущого Діджорджіо. У 1992-му на фестивалі в Детройті разом з "Mortician", "Vital remains" і "Repulsion" група виступала як тріо, оскільки Ерік Катлер зламав собі руку.
У тому ж році Стів Катлер остаточно попрощався з "Autopsy", і в команду на постійній основі був прийнятий Джош Барон.
На альбомі "Acts Of The Unspeakable" група продовжувала довбати свій своєрідний з дез з шокуючими текстами. Не обійшлося цього разу без інцидентів. Так австралійським владі не сподобалася обкладинка платівки, і вони заборонили її продаж, а в Німеччині конфіскували партію футболок з подібними зображеннями. Але учасників "Autopsy" це анітрохи не бентежило, і на альбомі "Shitfun" знову можна було побачити заголовки треків типу "Bowel Ripper", "Burnt To A Fuck" і "Excremental Ecstasy". Правда, після виходу цього диска група проіснувала недовго і незабаром була розпущена. Музиканти розбрелися хто куди, а Кріс Рейферт заснував новий проект "Abcess".
У 2001 році спеціалізується на дез-метал лейбл "Necroharmonic Productions" випустив збірник ранніх речей "Autopsy" під назвою "Ridden With Disease", а також максі-сингл з концертних треків "Tortured Moans Of Agony". "Рідний" ж лейбл групи, "Peaceville", в тому ж році видав компіляцію "Torn from the grave".