Цей квінтет було сформовано в штатівської містечку Сіетл Джефом Ейментом (р. 10 березня 1963, Біг Сенді, США; бас) і Стоуном Госсардом (р. 20 липня 1965, Сіетл, США; ритм-гітара). Госсард грав зі Стівом Тернером в "Ducky Boys", а потім Стів перебрався до Ейменту в "Green River". Стоун приєднався до них, коли Марк Арм (який, як і Тернер, пізніше приєднався до "Mudhoney") переключився з гітари на вокал.
Коли "Green river" розпалася, і частина її членів перейшла до проекту Ендрю Вуда "Mother Love Bone", Госсард і Еймент продовжили працювати разом. Однак ця нещаслива команда розвалилася, коли, чотирма тижнями після випуску їх дебюту 1990-го "Apple", Вуд був знайдений мертвим від передозування героїну. Госсард і Еймент згодом брали участь на концерті пам'яті Вуда. Вони грали разом з Крісом Корнеллом і Меттом Камероном з "Soundgarden", а допомагав їм шкільний друг Стоуна Майк Маккреді (р. 5 квітня 1966, Пенсакола, США; гітара). Вокалістом у них був екс-учасник "Bad Radio" Едді Веддер (Едвард Луї Северсен Другий, р. 23 грудня 1964, Еванстон, США).
Веддер і Маккреді згодом приєдналися до Ейменту і Госсарду, щоб організувати "Pearl jam" (спочатку групу хотіли назвати "Mookie Blaylock"). Місце за ударною установкою зайняв Дейв Крус. Команда уклала контракт з "Epic Records" і в 1991 році дебютувала з потужним альбомом "Ten". До того часу Крусі пішов з групи і був замінений Дейвом Аббруззесом.
"Pearl jam" успішно поєднали нові віяння (типу "Soundgarden", "Nirvana") з впливом старшого покоління ("Doors", "Velvet underground" і "Stooges"). Спродюсована самими музикантами запис показала велику зрілість для дебюту, особливо проявилася в композиціях "Alive" і "Jeremy". "Pearl jam" відразу ж стали знаменитими завдяки своїм динамічним концертів і тонкому комерційному чуттю до підбору матеріалу. В Америці "Ten" протримався у двадцятці кращих майже три роки після свого виходу. Проте нескінченні гастролі поставили Веддер на грань нервового зриву. Але до 1992 року він зумів впоратися зі своїми проблемами і брав участь у зйомках фільму "Singles", на концерті "MTV Unplugged" та у турі "Lollapalooza II". На наступний рік Веддер брав участь на церемонії введення "Doors" в Зал Слави Рок-н-ролу. Разом з возз'єдналися членами цієї команди він виконав "Roadhouse Blues", "Break On Through" і "Light My Fire". "Pearl jam" супроводжували також канадця Ніла Янга в його літньому турне 1993 року. Госсард, тим часом, паралельно брав участь у проекті "Brad".
Нарешті в жовтні 1993 року на прилавках магазинів з'явився довгоочікуваний другий альбом групи "Vs", що вийшов незабаром після релізу від "Нірвани". Хоча відгуки на нього були суперечливі, це не завадило альбому потрапити у верхівку штатівських чартів. Наступний диск "Vitalogy" теж опинився на вершині хіт-парадів.
Як не дивно в 1994-му група обходилася без Аббруззеса, і почали ходити чутки його місце повинен зайняти Дейв Грохл з "Nirvana". Тим не менш, новим барабанщиком "Pearl jam" став Джек Айронс (екс-"Red hot chili peppers"). У 1995 році Маккреді випустив альбом зі своїм побічним проектом "Mad Season", а також разом зі своєю командою взяв участь у записі альбому Ніла Янга "Mirror Ball". На своєму новому диску "No code" "Перл джем" відійшов від свого звичного саунду і зобразив щось експериментальне напівакустичні. Наступний альбом "Yield" був зроблений у хард-роковій манері і особливого комерційного успіху не мав, незважаючи на потрапляння на другу сходинку хіт-парадів. У 1998 році Айронса на барабанах змінив Метт Камерон (екс-"Soundgarden"), який брав участь у записі концертний альбом "Live: On Two Legs". Влітку 1999 року популярність "Pearl jam" підстрибнула з виходом синглу з кавер-версією Уейна Кочран "Last kiss". Рік 2000-й виявився екстраординарним для колективу. На додаток до нового студійного альбому "Binaural", група та її записуюча компанія вирішили влаштувати конкуренцію бутлеггерам.В вересні вони випустили безпрецедентні 25 окремих подвійних альбомів живих концертів з їх недавнього європейського туру. П'ять з них потрапили в Топ 200 "Billboard". "Pearl jam" встановили своєрідний рекорд, ставши першою групою, яка потрапила в чарти з п'ятьма новими альбомами протягом тижня. Шістьма місяцями пізніше група продовжила своє починання, випустивши ще купу дисків, цього разу документувати їх американський тур. З них на першому тижні в чарти потрапили вже сім альбомів.