Хоча Тоні Макалпайн і вважається віртуозом гітари, свою музичну освіту він починав з освоєння піаніно та скрипки. Навчання в спрінгсфілдской консерваторії помітно вплинула на творчість Макалпайна і згодом він часто використовував у своїх опусах класичні і джазові елементи. Першим фатальним досвідом Тоні була якась кавер-банда, але перебування гітариста в ній виявилося недовгим.
Макалпайн записав кілька плівок і відправив їх ватажку "Shrapnel records" Майку Барнеа.
Тому демки сподобалися, і він запросив Тоні перебратися з Массачусетсу до Каліфорнії. Для запису дебютного альбому Барнеа порадив Макалпайну не найгірших партнерів - басист Біллі Шихан працював у Девіда Лі Рота, а ударник Стів Сміт у свій час стукав у "Journey".
Після "Edge of insanity", характеризувалася емоційним виконанням і імпровізаціями, Тоні організував проект "MARS" в компанії з Томмі Олдріджем (ударні), Робом Роком (вокал) і Руді Сарзо (бас). Група випустила всього один альбом ("Project driver") і відразу розпалася. Після цього гітарист повернувся до сольної кар'єри і в 1987 році на лейблі "Squawk" випустив один зі своїх кращих альбомів, "Maximum security". Серед помічників цього разу у Тоні значилися Дін Кастронова, Атмар Ануров, Джефф Уотсон і Джордж Лінч.
Якщо "Maximum security" був повністю інструментальним, то на наступному альбомі, "Eyes of the world", з'явився вокал, а роль мікрофонщіка виконав Алан Шорно. Крім Шорно у записі брали участь клавішник Марк Робертсон, ударники Біллі Кармассі і Майк Жак, басист Ренді Джексон. На платівці звучав звичайний мелодік-рок, розбавлений невеликими гітарними соло.
Далі Макалпайн повернувся до чистого інструментали, продемонструвавши свій талант на диску 1992 року "Freedom to fly". У 1993-м на "Shrapnel records" вийшов черговий інструментальний альбом, "Madness". Хоча мелодійність і раніше залишалася, гітарист на цьому релізі привніс у свою музику багато джазових елементів. Ще через рік Макалпайн зробив ухил у бік хард-року, рясно присмачивши його неоклассикой. Багато неокласики було і на наступному "Evolution", хоча матеріал цього альбому був більш різноманітним ніж на "Premonition".
Зробивши кілька студійних робіт, в 1997 році Макалпайн випустив свій перший "лайв". Концертний альбом "Live insanity" був записаний під час гастролей, в яких гітарист супроводжували басист Ріккі Рікардо і барабанщик Майк Террана. Після сольного альбому 2001 Тоні на деякий час пригальмувало сольну діяльність і присвятив себе таким проектам як "Planet X" і "CAB". Крім того гітарист частенько з'являвся на альбомах інших музикантів (Вінні Мур, Віталій Купрій, Тоши Іседа та ін.)